El fallo que sigue se da conjuntamente con el gestor de descargar Star Downloader y en windows (en mi caso XP) (no, en cambio, en linux junto con el gestor de descargas Kget), aunque tengo la impresión de que podría darse con otros gestores de descargas o con todos.
El fallo se hace notorio no respecto de las descargas, sino del funcionamiento de los botones de navegación de páginas visitadas, anterior (<-) y siguiente (->), que quedan difuminados e inservibles. También crea un mal funcionamiento de las pestañas (no tengo extensión alguna de manejo de pestañas, por lo que no es incompatibilidad con ninguna de este tipo).
La solución es muy simple: basta ir al directorio del perfil de seamonkey y borrar el fichero flashgot.log y reiniciar seamonkey. Tras ello funcionan de nuevo dichos botones, configuración de pestañas (y también la extensión flashgot).
He revisado ese archivo flashgot.log y al parecer resulta que la extensión, al instalarse, no solo busca en el disco Duro todos los programas de gestión de descargas que su base de datos lleva, sino que intenta habilitarlos, al no encontrarlos todos, crea el error.
Posiblemente el error puede que haya sido solucionado, ya que con el sistema de actualización de extensiones de firefox, he visto como en una semana se ha actualizado la versión de esa extensión, como mínimo 3 veces. En cambio, SeaMonkey no tiene (o yo no se dónde está) esa función de actualización de extensiones instalada.
En Firefox, el fallo descrito no se da.